Zdravstvene dobrobiti probiotika nisu samo povezane s korištenim sojevima, već su usko povezane i s dozom. Znanstvena istraživanja pokazuju da se probiotici mogu kolonizirati, razmnožavati i vršiti regulatorne učinke u crijevima samo ako se konzumiraju u dovoljnim količinama. To im omogućuje poboljšanje crijevne mikrobiote, promicanje probave i apsorpcije hranjivih tvari ili jačanje imuniteta. Međutim, učinkovita doza varira ovisno o soju. Na primjer, neki sojevi mogu proizvesti pozitivne učinke pri dnevnom unosu od samo nekoliko stotina milijuna živih stanica, dok su drugima potrebne veće količine kako bi se postigla zamjetna korist.
Za isti soj, unutar određenog raspona, veća je vjerojatnost da će viša doza proizvesti značajne zdravstvene prednosti nego niža doza. Međutim, to ne znači da je „više uvijek bolje“. Prekoračenje preporučene doze neće trajno pojačati učinak i može čak dovesti do gubitka ili, u nekim slučajevima, povećati rizik od gastrointestinalne nelagode.
Štoviše, budući da različiti sojevi imaju različite karakteristike i mehanizme djelovanja, jednostavna usporedba broja živih stanica u proizvodu ne ukazuje na njegovu ukupnu učinkovitost. Znanstveniji način za procjenu učinkovitosti probiotika je pozivanje na kliničke dokaze koji podupiru određeni soj, a ne samo na količinu. Prilikom odabira proizvoda potrošači bi se trebali usredotočiti na sojeve s kliničkim istraživanjima i mjerodavnim certifikatima, odabirući one koji odgovaraju njihovim individualnim potrebama umjesto da slijepo traže visoke doze ili golem broj živih bakterija.